此菜为临清官府菜，也是临清传统蒸碗之一（临清蒸碗有：粉蒸肉、花椒肉、腐乳肉、辣子肉、黄焖鸡等），用上等的五花肉、花椒等其它佐料上笼蒸制而成，肥而不腻，老少皆宜，具有养颜美容、滋补之效。抗日名将张自忠犹爱食之，所部每与日寇决战或将士凯旋，将军必用家乡花椒扣肉犒赏官兵，从而传为佳话。
相传在明朝时期，临清有一位富商，名叫李富贵。他经营着一家酒楼，生意兴隆，每天客流量很大。李富贵虽然富有，但为人却十分吝啬，经常克扣员工的工资，对待客人也总是斤斤计较。有一天，李富贵的酒楼来了一位从外地来的贵宾，这位贵宾听说临清的花椒扣肉很有名，于是特意来品尝。李富贵为了展示自己的厨艺，亲自下厨制作了这道菜。
然而，由于他的吝啬本性，他在制作过程中故意减少了花椒的用量，使得花椒扣肉的味道大打折扣。贵宾品尝后，发现花椒扣肉的味道并不如传说中的那样美味，于是便问李富贵这是怎么回事。李富贵见隐瞒不住，只好如实告诉贵宾他在制作过程中减少了花椒的用量。
贵宾听后十分生气，认为李富贵这是在砸自己的招牌，于是拂袖而去，再也没有光顾他的酒楼。此事过后，李富贵深感懊悔，他意识到自己的吝啬不仅失去了贵宾，还可能影响到酒楼的声誉。于是，他决定改正自己的错误，重新制作花椒扣肉。这次，他不再克扣原料，而是按照传统工艺，加入足量的花椒，制作出了美味的花椒扣肉。经过这次事件，李富贵意识到品质的重要性，他开始注重食材的品质和味道，使得酒楼的生意逐渐恢复，并变得更加兴隆。而花椒扣肉也成为了临清的一道名菜，流传至今。